Comme les salariés, l’auto-entrepreneur peut prétendre au versement d’indemnité journalière (IJ) en cas d’arrêt maladie, et ce indépendamment du fait qu’il ait ou non souscrit une mutuelle. Ces indemnités sont néanmoins soumises à des conditions de revenus et varient en fonction de l’activité exercée. Vous souhaitez en savoir plus sur le sujet ? Alors, suivez-nous ! 🚀

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📄 En résumé :
- L’auto-entrepreneur, tout comme les autres professionnels indépendants, a le droit à une indemnité en cas d’arrêt maladie ;
- Le montant de cette dernière dépendra de son activité ainsi que de son chiffre d’affaires sur les 3 dernières années ;
- Pour bénéficier du versement, vous devrez transmettre votre arrêt de travail à la CPAM dans les 48 heures ;
- Un délai de carence s’applique, ce dernier est de 3 jours.
Sommaire
- Les indemnités journalières, qu’est-ce que c’est ?
- Je suis auto-entrepreneur, quels sont les critères pour être indemnisé en cas de maladie ?
- Les indemnités journalières de l’auto-entrepreneur commerçant ou artisan
- Les indemnités journalières du professionnel libéral
- Les indemnités journalières de l’auto-entrepreneur salarié
- Comment déclarer un arrêt maladie en auto-entreprise ?
- Quelle est la durée de l’indemnisation ?
Les indemnités journalières, qu’est-ce que c’est ?
Les indemnités journalières sont versées par l’Assurance Maladie (notamment connu sous le sigle CPAM) pour compenser un arrêt de travail. Ces dernières sont versées après un délai de carence et sont soumises à des conditions d’obtentions. Enfin, notez que ces dernières sont calculées à partir de vos revenus.
🧑🏻⚕️ Bon à savoir : Vous êtes auto-entrepreneur ? Souscrire une mutuelle n’est pas obligatoire ! Cette dernière viendra néanmoins compléter les remboursements de la sécurité sociale.
Je suis auto-entrepreneur, quels sont les critères pour être indemnisé en cas de maladie ?
Vous êtes auto-entrepreneur commerçant ou artisan
Dans un premier temps, le micro-entrepreneur exerçant une activité commerciale ou artisanale, à le droit aux indemnités journalières en cas de maladie, à condition de respecter plusieurs conditions :
- Vous êtes inscrit au régime obligatoire de la sécurité sociale depuis au moins un an (soit 12 mois d’affiliation continue) ;
- Vous êtes dans l’incapacité de continuer ou reprendre votre activité professionnelle ;
- Vous avez un arrêt de travail prescrit par votre médecin traitant ;
- Vous avez arrêté votre activité.
Vous êtes auto-entrepreneur libéral
Les professionnels libéraux y compris les praticiens et auxiliaires médicaux conventionnés (PAMC) sont également concernés par les indemnités journalières versées à l’occasion d’arrêts de travail.
🧑🏻💼 Vous êtes avocat ? Alors vous n’êtes pas concernés par les IJ versées par la CPAM ! En effet, vous disposez déjà d’une couverture privée et obligatoire d’indemnités journalières.
Pour prétendre à une indemnisation vous devez remplir les conditions suivantes :
- Être affilié à la SSI depuis au moins 1 an ;
- Vous êtes dans l’incapacité de travailler ;
- Vous avez un arrêt de travail prescrit par votre médecin traitant ;
- Vous étiez en activité au moment de l’arrêt de travail ou bénéficiez d’un maintien de droit à la date du certificat médical.
💡 Vous êtes auto-entrepreneur libéral et cotisez à la CIPAV ? Depuis juillet 2021, toutes les professions libérales (réglementées et non réglementées) ont le droit aux indemnités journalières. Ce droit est donc aussi ouvert aux professions libérales dépendant de la CIPAV ! Ainsi, pour toucher les IJ, vous devez remplir les conditions suivantes :
👉 Être affilié à la Cipav depuis au moins 1 an ;
👉 Votre revenu est au moins égal à 10 % du plafond annuel de la sécurité sociale (PASS).
Les indemnités journalières de l’auto-entrepreneur commerçant ou artisan
Comment calculer vos IJ ?
Le montant de vos indemnités journalières dépendra de votre Chiffre d’affaires. Ce dernier correspond à 1/730e de votre revenu moyen des trois dernières années civiles (après abattement).
Ainsi, vous devrez calculer votre revenu moyen annuel (également connu sous le sigle RAAM). Ce dernier est égal à votre chiffre d’affaires moins l’abattement forfaitaire.
💡 Petit rappel : Le taux d’abattement dépend de la nature de votre activité, ce dernier s’élève à :
- 71 % pour les activités de vente relevant des bénéfices industriels et commerciaux (BIC) ;
- 50 % pour les prestations de services relevant des BIC ;
- 34% pour les prestations de services et activités libérales.
Vous pourrez ensuite diviser votre RAAM par 1/730ème.
Autrement dit, le calcul de l’IJ est le suivant :
👉 IJ = 1/730 X Revenu annuel moyen des 3 dernières années 👈
Notez que vos revenus sont pris en compte dans la limite du plafond annuel de la sécurité sociale (PASS) en vigueur au jour du constat médical de l’incapacité de travail, soit 47 100 € bruts au 1er janvier 2025. Autrement dit, même si votre revenu d’activité annuel moyen est supérieur à 47 100 €, votre IJ ne pourra pas excéder le montant maximum de 64,52 € bruts fixés au 1er janvier 2025.
⌨️ Le saviez-vous ? Des simulateurs sont disponibles sur Internet ! Ces derniers vous permettent d’estimer le montant de vos indemnités journalières en fonction de votre situation !
Notre exemple
Un exemple concret sera peut-être plus parlant :
Vous exercez une activité de prestation de service. Vous avez engrangé
- 30 000€ de chiffre d’affaires en 2022 ;
- 35 000€ en 2023 ;
- 40 000€ en 2024.
Votre chiffre d’affaires moyen sur ces 3 dernières années était de (30 000 + 35 000 + 40 000) / 3 = 35 000€.
A ce montant, nous devons soustraire l’abattement correspondant à la nature de votre activité. Puisque vous exercez une activité de prestation de service, ce dernier s’élève à 50 %. Ainsi, 35 000 x (1-0,5) = 17 500. Votre RAAM est donc de 17 500€.
Enfin, nous devons calculer l’indemnité journalière. Cette dernière s’élève à 1/730 x 17 500 = 23,97€ par jour.
💰 Le saviez-vous ? Le montant de votre indemnité journalière est nul si votre revenu d’activité annuel moyen des 3 années civiles d’activité précédant votre arrêt de travail est inférieur à 10 % de la moyenne des valeurs annuelles du plafond de la sécurité sociale en vigueur au cours des 3 années considérées (soit 4 383,20 € en 2025).
Les indemnités journalières du professionnel libéral
Comment calculer vos IJ ?
Tout comme les auto-entrepreneurs commerçants ou artisan, l’IJ en profession libérale est égale à 1/730e de votre revenu moyen des trois dernières années civiles. Comme indiqué plus haut, votre revenu moyen est égal à votre chiffre d’affaires moins l’abattement applicable en fonction de votre activité (soit 34%).
La moyenne de vos revenus pris en compte est plafonnée à 3 fois le montant du PASS en vigueur au jour du constat médical de l’incapacité de travail, soit 3 x 47 100 € bruts au 1er janvier 2025. Autrement dit, même si votre revenu d’activité annuel moyen est supérieur à ce plafond, votre indemnité journalière ne pourra pas excéder le montant maximum de 193,56 € bruts fixés au 1er janvier 2025.
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Notre exemple
Vous êtes architecte d’intérieur en libéral 🛋️
Vous avez réalisé un chiffre d’affaires de 50 000€ en 2022, 60 000€ en 2023 et 55 000€ en 2024. Ainsi, votre CA sur les 3 dernières années était en moyenne de 55 000€, moins l’abattement forfaitaire de 34 % = 36 300€ de RAAM.
On doit ensuite calculer l’indemnité journalière : 1/730 x 36 300 = 49,72 €.
Ainsi, en cas de maladie, votre indemnité s’élèvera à 49,72 € par jour.
Les indemnités journalières de l’auto-entrepreneur salarié
Vous êtes auto-entrepreneur, et exercez en parallèle une activité de salarié ? En cas d’arrêt maladie, vos indemnités journalières seront versées par la CPAM (Caisse primaire d’Assurance Maladie). Ici, le calcul est uniquement basé sur votre salaire et non pas sur vos revenus d’auto-entrepreneur.
Votre arrêt de travail est inférieur à 6 mois
- Vous devez avoir travaillé au minimum 150 heures au cours des trois mois civils ou 90 jours précédant l’arrêt de travail ;
- Sinon, vous devez avoir cotisé sur un salaire au moins égal à 1 015 fois le montant du SMIC horaire soit 11 824,75 euros en 2025, au cours des 6 mois civils précédant l’arrêt de travail.
Votre arrêt de travail est supérieur à 6 mois :
- Vous devez avoir effectué au moins 600h de travail au cours des 12 mois civils ou des 365 jours qui précèdent l’arrêt de travail ;
- Ou avoir cotisé sur un salaire de 2 030 fois le montant du SMIC horaire pendant 12 mois avant l’arrêt maladie ;
- En parallèle, vous devez être assuré par l’Assurance Maladie depuis au moins un an (vous devez être en mesure de le prouver).
Comment déclarer un arrêt maladie en auto-entreprise ?
La procédure à suivre pour déclarer un arrêt maladie en tant qu’auto-entrepreneur est la même que pour les salariés.
Pour déclarer votre arrêt, vous devez :
1️⃣ Transmettre votre arrêt maladie (les volets 1 et 2) à l’assurance maladie dans les 48 heures. Pour cela, vous pouvez contacter votre agence par :
- 📮 Voie postale ;
- 📩 E-mail ;
- ☎️ Téléphone. Vous pouvez contacter votre agence au 3648 pour les prestations et services et au 3698 pour les cotisations.
2️⃣ Être présent à votre domicile pendant les heures de présence obligatoire. Autrement dit, en cas d’arrêt maladie, vous ne devez pas quitter votre domicile entre 9 h et 11 h et l’après-midi entre 14 h et 16 h excepté pour vous rendre à un rendez-vous de soins ou d’examens médicaux.
3️⃣ Arrêter réellement votre activité professionnelle. Même s’il peut être tentant de continuer à travailler, vous n’avez pas le droit de continuer à exercer votre activité en étant en arrêt maladie.
👉 Vous souhaitez reprendre votre activité plus tôt ? Vous devez impérativement prévenir la SSI ! 🕦
Quelle est la durée de l’indemnisation ?
La durée d’indemnisation
Vous êtes affilié à la SSI ?
La période d’indemnisation est de :
- 360 jours en cas d’arrêt maladie sur une période glissante de 3 ans au titre d’une ou plusieurs maladie ;
- 90 jours en cas de temps partiel thérapeutique sur une période de 3 ans ;
- Enfin, vous pouvez toucher l’indemnité dans le cadre d’une maladie longue. Ainsi, la période d’indemnisation est de 3 ans pour les affections de longue durée (ALD) ou soins de longue durée (SLD).
Vous êtes affilié à la CIPAV ?
Ici, vous serez indemnisé pour une période maximale de 90 jours (soit 97 jours avec le délai de carence).
Le délai de Carence
Tout comme pour les salariés, un délai de carence s’applique avant le versement des indemnités journalières. Sa durée dépend du motif justifiant l’arrêt de travail. Ce dernier est de 3 jours en cas d’hospitalisation ou d’arrêt de travail de plus de 7 jours.
🩻 Bon à savoir : Le délai de carence est de 3 jours en cas d’arrêt maladie de plus de 7 jours ou d’hospitalisation. Autrement dit, vous ne serez pas indemnisé en cas d’arrêt de travail inférieur à 7 jours.
Autrement dit, vos IJ sont dues à compter du 4e jour d’arrêt de travail. Votre caisse d’assurance maladie, verse vos indemnités journalières tous les 14 jours en moyenne. Vos relevés de remboursement seront alors disponibles depuis votre compte Ameli. Pour vous connecter à votre compte, c’est 👉 par ici 👈 !
Enfin, le délai de carence ne s’applique pas dans les cas suivants :
- Si votre arrêt est dû à une affection de longue durée (ALD). Dans ce cas, le délai de carence s’applique uniquement pour le premier arrêt de travail ;
- Si vous bénéficiez d’une prolongation de votre arrêt de travail, après une reprise d’activité de 48 heures maximum entre la fin de votre arrêt initial et le début de l’arrêt de prolongation ;
- Si vous êtes en arrêt de travail à la suite d’une interruption spontanée de grossesse.
Vous avez la moindre interrogation au sujet des indemnités journalières en cas d’arrêt maladie de l’auto-entrepreneur ? Laissez-nous un message en commentaire, nous nous ferons un réel plaisir de vous éclairer ! 💡
Bonjour,
Je travaille depuis 17 ans en tant que salariée dans une banque. Depuis juillet 2025 j’ai déclaré ma petite entreprise (je n’ai pas fais encore de chiffre d’affaire) mais je continue à travailler à 100% à la banque. J’ai dû m’arrêter 4 jours et je n’ai pas été indemnisé par l’assurance maladie qui a pris en compte mon compte entrepreneur et non pas le compte salarié . Est ce que c’est normal?
Bonjour Christelle,
La CPAM aurait dû prendre en compte votre compte salarié en effet, il faut leur faire part de leur erreur. Votre activité principale est bien votre activité salariée, d’autant plus que vous ne faites pas de CA avec votre entreprise.
Bonjour, j ai deux tumeurs détectés en février et mars 2022 et le diagnostic de double cancer est tombé en juillet 2022. D autre part je suis en ald depuis fin 2024 pour une endometriose. Je n ai touché que 90 jours ijj au début du droit aux ij pour les autoentrepreneurs soit jusqu à juillet. Mais d après ce que je lis étant toujours arrêté à cause des mes cancers et endometriose j aurais du continuer à toucher des ij après juillet 2022. Comment faire valoir cela auprès des agents de la cpam. Auriez-vous vous un lien vers un document officiel ou autre? Merci beaucoup
Bonjour Marie-Therese,
Le calcul des IJ et du temps d’idemnisation dépend de beaucoup de critères : votre caisse d’assurance maladie (SSI ou Cipav), votre profession (libéral, artisan, commerçant), votre revenu avant votre arrêt, etc. Seule la CPAM pourra vous dire précisément vos droits, et notamment si une autre indemnisation de votre arrêt est possible.
Je suis auto entrepreneur et je paye mon urssaf tous les mois , je travaille entre 6 et 8 mois par an avec des revenus différends suivant la saison , étant dans les espaces verts ai je droit à des ij en cas de maladie ou accident de travail trajet en voiture compris
Bonjour Françoise,
En tant qu’auto-entrepreneur, vous avez droit aux indemnités journalières (IJ) en cas de maladie, à condition :
– D’être affiliée à la sécurité sociale depuis au moins un an ;
– D’avoir un arrêt de travail prescrit par un médecin ;
– Que votre revenu soit au moins égal à 10 % du plafond annuel de la sécurité sociale.
Vous respectez ces conditions ? Alors vos IJ seront calculées sur la base de votre revenu annuel moyen, dans le cas contraire, vous ne pourrez pas toucher d’IJ.
Bonjour Françoise,
En tant qu’auto-entrepreneur, vous avez droit aux indemnités journalières (IJ) en cas de maladie, à condition :
– D’être affiliée à la sécurité sociale depuis au moins un an ;
– D’avoir un arrêt de travail prescrit par un médecin ;
– Que votre revenu soit au moins égal à 10 % du plafond annuel de la sécurité sociale.
Vous respectez ces conditions ? Alors vos IJ seront calculées sur la base de votre revenu annuel moyen, dans le cas contraire, vous ne pourrez pas toucher d’IJ.