Les meilleurs logiciels de comptabilité pour les auto-entrepreneurs en 2024

Un logiciel de comptabilité peut sembler accessoire pour un auto-entrepreneur au vu de la simplicité des formalités. Cependant, Excel étant proscrit pour l’édition des documents comptables, c’est aujourd’hui un passage quasi obligé, à moins de ne faire appel à un expert-comptable, souvent plus onéreux. Quels sont les meilleurs logiciels de comptabilité pour les auto-entrepreneurs ? Comment choisir son logiciel de comptabilité en ligne et quels en sont les avantages ? Découvrez dans cet article le comparatif des meilleurs logiciels comptables pour auto-entrepreneurs en 2024.

Les meilleurs logiciels de comptabilité pour les auto-entrepreneurs en 2024

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Ne cherchez plus, essayez-le ! Avec plus de 80 000 indépendants à son actif et des notes avoisinant les 5/5 sur Trustpilot, Google et Facebook, Indy se classe parmi les meilleurs du marché ! 🌟
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📝 En résumé : 

  • Parmi les meilleurs logiciels de comptabilité pour les auto-entrepreneurs figurent Indy, Abby, Freebe et Comptalib ;
  • Pour choisir votre logiciel comptable, vous devez :
    • Comparer les statuts juridiques adressables ;
    • Comparer les fonctionnalités ;
    • Comparer les prix ;
    • Vérifier la qualité et le format du support client ;
    • Comparer les avis clients.

Le comparatif des meilleurs logiciels de comptabilité pour les auto-entrepreneurs en 2024

Les critères de sélection

Afin d’établir notre comparatif des meilleurs logiciels de comptabilité pour les auto-entrepreneurs, nous avons pris en compte plusieurs critères, à savoir :

  • La notoriété du logiciel : est-il plébiscité sur le marché ? ;
  • Les fonctionnalités essentielles au statut d’auto-entrepreneur ;
  • L’ergonomie de l’interface ;
  • Le prix pratiqué.

Le saviez-vous ? Certains logiciels de comptabilité pour auto-entrepreneurs sont gratuits. Cela est intéressant, en particulier si votre chiffre d’affaires (CA) est limité. À titre d’exemple, MyAE est un logiciel de comptabilité gratuit pour les micro-entreprises (ou auto-entreprises) doté toutefois d’une interface vieillissante. Si ce type de logiciel peut s’avérer être utile en début d’activité, il pourrait devenir contraignant à mesure que votre activité se développe.

Ainsi, pour vous aider, vous trouverez ci-dessous une sélection des meilleures offres de logiciels de comptabilité en ligne pour les auto-entrepreneurs, présentant le meilleur rapport qualité/prix.

Les offres retenues

Indy : le meilleur logiciel de comptabilité pour les auto-entrepreneurs ? 🏆

Bien plus qu’un simple logiciel de comptabilité, Indy tend de plus en plus à devenir une application comptable tout-en-un. Conçue pour les travailleurs indépendants (auto-entrepreneurs, entrepreneurs individuels, sociétés), Indy souhaite optimiser la comptabilité de ces derniers sans pour autant qu’ils aient à se ruiner ! Avec plus de 80 000 indépendants à son actif et une note de 4,8/5 sur Trustpilot pour plus de 5000 avis, Indy se classe parmi les meilleurs logiciels de comptabilité du marché.

Indy propose 2 formules à destination des auto-entrepreneurs :

  • L’offre Indy gratuite comprenant :
    • Une interface facile à prendre en main ;
    • Le pilotage de votre activité en temps réel (avec des tableaux de bord intuitifs) ;
    • Un module de facturation pour éditer des devis et factures conformes et personnalisés ;
    • La gestion des justificatifs et notes de frais ;
    • La synchronisation bancaire ;
    • La catégorisation automatique des transactions ;
    • L’export du FEC (Fichier des écritures comptables) ;
    • Un service client réactif ;
    • … Et même un compte pro !
  • L’offre Indy Premium à 12€ par mois incluant :
    • Le rappel de vos échéances comptables par l’envoi de notifications ;
    • Le remplissage et l’envoi de vos déclarations de CA et de TVA (Taxe sur la valeur ajoutée).

Bon à savoir : Indy propose également un accompagnement à la création d’entreprise (compris dans la version gratuite) ! Nos experts vous conseillent sur votre statut juridique, votre régime fiscal et les aides auxquelles vous pouvez prétendre. De la préparation de votre dossier jusqu’à la réception de vos documents, Indy est à vos côtés !

Abby : un logiciel de comptabilité spécifiquement dédié aux auto-entrepreneurs

Abby est un logiciel de compta conçu pour répondre aux besoins des auto-entrepreneurs uniquement. Il intègre un module de comptabilité et centralise les dépenses et les recettes. Abby propose également d’autres fonctionnalités essentielles comme la facturation, le pilotage de l’activité, l’estimation du chiffre d’affaires (CA) et des cotisations sociales ainsi que la déclaration URSSAF.

Plus précisément, Abby propose 4 formules dont les tarifs oscillent entre 0€ et 24€ par mois. La formule complète vous permet de :

  • Éditer des devis et factures personnalisées ;
  • Télécharger votre livre des recettes et registre des achats ;
  • Estimer votre CA et vos cotisations sociales à payer à l’URSSAF ;
  • Synchroniser votre compte bancaire ;
  • Signer des documents en ligne ;
  • Éditer des documents en devises et langues étrangères ;
  • Obtenir la déclaration NOVA et l’attestation fiscale ;
  • Exporter le FEC ;
  • Obtenir le prévisionnel de trésorerie ;
  • Télé-déclarer la TVA.

ℹ️ Notez que plus l’offre est onéreuse, plus l’accompagnement dispensé est qualitatif, allant d’un simple support client à un conseiller dédié.

Attention toutefois ⚠️ : Abby est un logiciel spécialement conçu pour les auto-entrepreneurs. Par conséquent, il n’est pas adapté à d’autres statuts juridiques comme l’entreprise individuelle ou la société. Nous savons que la micro-entreprise est soumise à des plafonds de CA (188 700€ ou 77 700€ selon la nature de votre activité). Si vous changez de statut, il sera donc probablement nécessaire de changer de logiciel.

Freebe : une solution à destination des micro-entrepreneurs

Tout comme Abby, Freebe est un logiciel de comptabilité qui s’adresse uniquement aux micro-entrepreneurs. Sa promesse ? Permettre aux utilisateurs d’optimiser la gestion des tâches administratives liées à la facturation et aux déclarations, de sorte qu’ils puissent se concentrer sur le cœur même de leur métier. Avec Freebe, vous pouvez :

  • Ajouter vos clients à l’aide de leurs données (nom, prénom, etc.) ;
  • Créer des devis et factures rapidement ;
  • Synchroniser votre compte en banque ;
  • Télécharger votre livre des recettes et registre des achats ;
  • Automatiser votre déclaration de CA à l’URSSAF ;
  • Payer en ligne ;
  • Obtenir une vue d’ensemble et un suivi des plafonds de CA et de TVA.

Vous pouvez choisir de payer l’abonnement chaque mois (15€ par mois), chaque trimestre (40€ par trimestre) ou chaque année (150€ par an).

Comptalib : l’application qui automatise la comptabilité des freelances

Enfin, Comptalib est une application comptable qui automatise la comptabilité des freelances. À destination des auto-entrepreneurs, Comptalib propose un pack Accompagnement à 188,80€ incluant une aide pour les formalités administratives et l’obtention de l’extrait K-bis.

Le logiciel comptable au tarif de 71,28€ par an pour les auto-entrepreneurs permet de :

  • Effectuer une comptabilité de trésorerie ;
  • Télé-déclarer le TVA ;
  • Bénéficier de tableaux de bord intuitifs en temps réel ;
  • Éditer des devis et factures en illimité ;
  • Synchroniser votre compte en banque.

Tableau comparatif des logiciels Indy, Abby, Freebe et Comptalib

⚙️ Critères Indy Abby Freebe Comptalib
🎯 Pour qui ? ✅ Micro-entreprise ;
✅ Entreprise individuelle ;
✅ Société ;
❌ Association
✅ Micro-entreprise ;
❌ Entreprise individuelle ;
❌ Société ;
❌ Association
✅ Micro-entreprise ;
❌ Entreprise individuelle ;
❌ Société ;
❌ Association
✅ Micro-entreprise ;
✅ Entreprise individuelle ;
✅ Société ;
✅ Association
🌟 Avis Trustpilot 4,8/5 pour plus de 5000 avis

⭐⭐⭐⭐⭐

Non trouvé 3/5 pour 8 avis

⭐⭐⭐

2,9/5 pour plus de 100 avis

⭐⭐⭐

🧰 Fonctionnalités
🛩️ Pilotage de l’activité en temps réel 🟢 🟢 🟢 🟢
🔌 Synchronisation du compte bancaire 🟢 🟢 🟢 🟢
🧠 Catégorisation intelligente des transactions 🟢 🔴 🔴 🔴
📋 Déclarations de CA et de TVA 🟢 🟢 🟠 Déclaration de CA uniquement 🟠 Déclaration de TVA uniquement
📤 Envoi des déclarations à l’administration fiscale 🟢 🟢 🟢 🟢
💻 Outil de facturation (factures et devis) 🟢 🟢 🟢 🟢
💳 Compte pro 🟢 🔴 🔴 🔴
📞 Service client 🟢 🟢 🟢 🟢
💰 Prix du logiciel de comptabilité à partir de 0€ / mois 0€ / mois 12,50€ / mois (si paiement à l’année) 71,28€ / an

Tableau mis à jour en mai 2024

Comment choisir son logiciel de comptabilité pour auto-entrepreneur ?

🤵‍♂️ Comparer les statuts juridiques adressables

Le logiciel est-il uniquement dédié aux auto-entrepreneurs ou est-il compatible avec d’autres statuts ? Choisir un logiciel de comptabilité spécifiquement conçu pour les auto-entrepreneurs peut sembler suffisant dans un premier temps. Toutefois, si votre entreprise évolue, assurez-vous qu’il s’adapte également à d’autres statuts en vue d’une potentielle augmentation de CA.

🧰 Comparer les fonctionnalités

Parmi la palette de fonctionnalités généralement proposées par les logiciels de comptabilité en ligne, certaines sont incontournables :

La synchronisation bancaire

Fonctionnalité reine des logiciels de comptabilité en ligne, la synchronisation bancaire permet à votre solution de comptabilité de se connecter à votre compte bancaire pour y récupérer toutes les opérations disponibles. C’est une fonctionnalité indispensable puisqu’elle fait économiser un temps certain, sans quoi vous devrez retaper manuellement toutes les opérations de votre compte. Ce qui, disons le clairement, est véritablement fastidieux.

La catégorisation automatique et l’enregistrement comptable

Pas indispensables aux auto-entrepreneurs mais intéressants si vous comptez changer de régime à long terme, la catégorisation automatique et l’enregistrement comptable permettent de classer chaque opération dans le bon compte comptable. C’est très utile surtout si on n’a que peu de connaissances en comptabilité. Un avantage facultatif pour vous, mais malgré tout non négligeable.

La tenue du livre des recettes ou du livre-journal

Le livre des recettes est une des seules obligations comptables des auto-entrepreneurs. Ce document comptable retrace, en résumé, vos recettes, leur date d’encaissement, la référence de la pièce justificative liée… Le livre journal est exactement la même chose avec vos dépenses en sus. Qu’ils proposent l’un ou l’autre, les logiciels de comptabilité en ligne vous permettront d’être en règle avec l’administration.

La déclaration de TVA

Utile uniquement si vous êtes assujettis à la TVA, cette fonctionnalité vous fera économiser des calculs fastidieux et un temps précieux lors de votre déclaration mensuelle, trimestrielle ou annuelle.

La gestion des justificatifs

Si votre logiciel de comptabilité en ligne gère les justificatifs de vos documents comptables, c’est une épine dans le pied en moins pour vous : plus besoin de conserver vos justificatifs sur votre ordinateur ou dans de volumineux classeurs, ils auront dorénavant valeur probante ! Cela signifie que leur numérisation est reconnue par l’administration. Vous aurez alors l’esprit tranquille !

La norme FEC obligatoire

La norme FEC, pour Fichier des écritures comptables, signifie que votre logiciel de comptabilité est habilité à produire un fichier FEC, indispensable à l’analyse de votre comptabilité par l’administration. En théorie les logiciels de comptabilité destinés au marché français en disposent tous, mais vérifiez bien que ce soit le cas, sinon votre logiciel vous sera malheureusement inutile.

Les autres considérations

Certains logiciels vous proposent également une documentation pour vous aider, un service client, un design et une ergonomie agréables, des outils de facturation… Une chose est sûre : Indy vous propose tout cela et bien plus encore, le tout sans frais cachés ! Mais en parlant de frais, comment comparer les prix de ces logiciels de comptabilité ?

💰 Comparer les prix

Si les prix des experts-comptables oscillent généralement entre 150€ et 200€ par mois, celui d’un logiciel de comptabilité dépassera rarement les 50€. Certains cabinets comptables en ligne sont moins chers, mais le « label » expert-comptable a un coût.

Les abonnements des logiciels de comptabilité sont souvent sans engagement ou sur une année : vous bénéficierez ainsi de plus ou moins de liberté en fonction du prestataire choisi.

Enfin, faites bien attention à ce qui est inclus ou non dans ces abonnements et qu’un supplément ne soit pas demandé pour une déclaration ou une certification des comptes : cette dernière n’est pas obligatoire en auto-entreprise.

Un auto-entrepreneur réalise le choix de son logiciel de comptabilité

📞 Vérifier la qualité et le format du support client

Le service client de la solution est-il réactif et de qualité ? Quel est le format du support client (téléphone, chat, e-mail, etc.) ? Le service client constitue votre principal interlocuteur. Ainsi, informez-vous à son sujet afin de bénéficier de l’accompagnement souhaité.

⭐ Comparer les avis clients

Un autre moyen de vérifier la qualité des logiciels de comptabilité est de regarder les avis sur internet pour se faire une idée : Trustpilot (ici), Facebook et Google vous donneront une bonne indication de leur qualité, ainsi que des éventuels avis négatifs sur ce qui pourrait vous bloquer.

 Indy détient tous les critères essentiels ! ✨
Conçu pour les indépendants, Indy propose un outil complet avec une large gamme de fonctionnalités et un service client réactif, le tout à des prix attractifs ne dépassant pas les 12€ par mois ! Faites confiance à nos clients, Indy est noté 4,8/5 sur Trustpilot et Facebook et 4,9/5 sur Google !
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Les avantages du logiciel de comptabilité pour un auto-entrepreneur

🚀 Une comptabilité plus sûre et rapide

Les logiciels de comptabilité en ligne étant pour la plupart dotés d’outils de synchronisation bancaire, vous vous mettrez à l’abri d’éventuelles erreurs de saisie qui peuvent arriver par mégarde. De plus, la catégorisation automatique de vos opérations vous permet d’être déjà prêt pour un éventuel passage en entreprise individuelle, suite logique du régime auto-entrepreneur.

Si les tâches administratives sont pour vous fastidieuses et que vous avez tendance à oublier les dates butoirs, vous bénéficierez dans la plupart des cas d’une aide au remplissage de vos déclarations liées à vos obligations comptables. Ainsi, les déclarations 2042-C-PRO et de TVA n’auront plus de secrets pour vous ! Vous saurez quand et où envoyer vos documents pour être dans les temps quoi qu’il arrive.

Autre avantage : utiliser un logiciel de comptabilité en ligne vous fera gagner du temps par rapport à une comptabilité à la main ou via un tableur type Excel. Nous vous rappelons que, concernant cette dernière solution, elle n’est pas acceptée par l’administration fiscale.

Enfin, outre le remplissage en bonne et due forme de vos obligations comptables, un logiciel de comptabilité en ligne vous permettra de piloter votre entreprise en fonction de vos recettes, de vos achats et des foyers de dépenses pour que vous fassiez disparaître les factures inutiles avec une prise de décision éclairée.

💶 Une comptabilité moins cher qu’avec un expert-comptable

La première chose que vous devez avoir en tête, c’est qu’un expert-comptable n’est pas obligatoire en auto-entreprise. Nous sommes loin du temps où tout entrepreneur devait se lier avec ces professionnels, qui s’ils sont très compétents ne sont pas toujours adaptés au budget de petits entrepreneurs.

Le prix d’un logiciel de comptabilité en ligne est bien moins onéreux : entre 2 et 5 fois moins cher que celui d’un expert-comptable traditionnel. De plus, ces derniers n’ont généralement que peu de responsabilité vis-à-vis des erreurs potentielles et donc un prix élevé ne vous couvrira pas forcément contrairement aux idées reçues.

Aujourd’hui vous pouvez parfaitement gérer votre comptabilité en ligne seul.e, à un coût bien moins élevé et au prix d’une poignée d’heures par an avec un peu d’organisation.

FAQ – Questions / Réponses

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité gratuit ?

Avec 4,8/5 sur Trustpilot, 4,8/5 sur Facebook et 4,9/5 sur Google, Indy se classe parmi les meilleurs logiciels de comptabilité gratuits, offrant une large gamme de fonctionnalités avec des formules aux prix attractifs et sans frais cachés.

Quelles sont les obligations comptables d’un auto-entrepreneur ?

Un auto-entrepreneur bénéficie d’une comptabilité simplifiée. En effet, celle-ci est réduite à la tenue du livre des recettes obligatoire pour tous, du registre des achats requis seulement pour les commerçants et de l’établissement des déclarations de TVA et de CA. À l’instar des autres statuts juridiques, les auto-entrepreneurs sont également tenus de conserver les documents comptables et justificatifs pendant 10 ans et d’établir des factures conformes.

Un auto-entrepreneur doit-il obligatoirement avoir un comptable ?

Non ! Un auto-entrepreneur n’est pas obligé d’avoir un comptable pour tenir sa comptabilité. Il peut parfaitement opter pour un logiciel de comptabilité, une solution tout aussi efficace et 2 à 5 fois moins chère.

Une question ou un avis concernant cet article ? Laissez-nous un commentaire dans l’espace ci-dessous, Indy y répondra dans les plus brefs délais ! 🤗

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par Valentine Flehoc

Valentine est responsable du contenu chez Indy et la comptabilité n'a plus de secrets pour elle. Grâce à ses articles et ebooks informatifs, elle aide les entrepreneurs à mieux comprendre les aspects essentiels de la comptabilité.